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135 artigos

A Biologia de Sistemas transforma a maneira como entendemos a vida, deixando de analisar partes isoladas para observar como milhares de componentes celulares interagem em redes complexas. Ao integrar dados de diferentes níveis biológicos, essa abordagem revela padrões ocultos que explicam desde o funcionamento de uma única célula até o comportamento de organismos inteiros, oferecendo uma visão mais holística e dinâmica da ciência da vida.

No Gist.Science, monitoramos diariamente o bioRxiv para trazer as descobertas mais recentes dessa área diretamente para você. Processamos cada novo pré-publicação em Biologia de Sistemas, oferecendo tanto resumos técnicos detalhados quanto explicações em linguagem simples, garantindo que pesquisadores e curiosos possam acessar e compreender avanços complexos sem barreiras.

Abaixo, você encontrará as pesquisas mais recentes publicadas no bioRxiv, organizadas para facilitar sua exploração pelas novidades que estão moldando o futuro desta disciplina fascinante.

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Uncertainty-aware graph representation learning with positive-unlabeled classification for biomarker discovery in peripheral artery disease

Este artigo apresenta um framework de aprendizado de representação em grafos consciente da incerteza que integra classificação positiva-não rotulada e métodos de ensemble para priorizar biomarcadores novos e bem calibrados para doença arterial periférica, demonstrando desempenho preditivo superior e relevância biológica em comparação com as linhas de base existentes.

Ayyalasomayajula, V. S. R. K., Senders, M. L., Wolterink, J. M., Yeung, K. K.2026-05-13
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Computer experimentation on E. coli ammonium transport and assimilation reveals mechanisms for energy coupling, balanced futile cycling, and robust growth

Através de experimentação computacional comparando seis modelos cinéticos, este estudo identifica um mecanismo de eletro-ligação para o transporte de amônio em E. coli que explica o acoplamento energético e revela como a regulação coordenada do transportador AmtB e da glutamina sintetase minimiza o ciclo fútil para garantir um crescimento robusto sob condições ambientais variáveis.

Maeda, K., Kurata, H., Javelle, A., Westerhoff, H. V., Boogerd, F. C.2026-05-13
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TRAFIKK: systematic prediction and mechanistic interpretation of anticancer drug synergies

O artigo apresenta o Trafikk, um framework baseado em redes de sinalização molecular que alcança alta precisão preditiva para sinergias de fármacos anticâncer, ao mesmo tempo em que fornece insights mecanísticos sobre como esses efeitos sinérgicos emergem em diversos contextos celulares.

Farinas, M., Bermudez, V., Tsirvouli, E., Zobolas, J., Aittokallio, T., Lehti, K., Flobak, A., Lippestad, K.2026-05-12
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Cross-tissue multiomics reveals that Akkermansia muciniphila counteracts metabolic syndrome by reprograming gut microbiota, oleoylethanolamide and the gut-hypothalamus axis

Este estudo demonstra que *Akkermansia muciniphila* alivia a síndrome metabólica induzida por frutose ao reprogramar a microbiota intestinal e o metaboloma para elevar os níveis de oleoiletanolamida, o que subsequentemente ativa o eixo intestino-hipotálamo para melhorar a saúde metabólica.

Ha, S. M., Ahn, I.-S., Kowal-safron, T., Yoon, J., Olson, C. A., Diamante, G., Cely, I., Zhang, G., Wang, S., Garcia, K. (…)2026-05-11
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Simulation-conditioned generative modeling for biologically realistic pattern prediction

Este artigo apresenta um framework generativo condicionado a simulações que combina modelos mecanísticos de granularidade grosseira com modelos de imagem fundacionais para produzir padrões sintéticos biologicamente realistas, permitindo a inferência de condições experimentais iniciais a partir de dados biológicos reais onde amostras experimentais são escassas.

Sahu, K., Davis, H. M., Lu, J., Villalobos, C. A., Heyman, A., Simsek, E., You, L.2026-05-11
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Pan-cancer proteogenomic interrogation of the Ubiquitin Proteasome System

Ao integrar dados proteogenômicos harmonizados de 11 coortes do CPTAC, este estudo revela como mutações somáticas, particularmente a perda de TP53, e fatores específicos de linhagem impulsionam um redesenho distinto e dependente de contexto do sistema ubiquitina-proteassoma, definindo assim novos quadros mecanísticos e vulnerabilidades terapêuticas para terapia de degradação de precisão.

Gonzalez Robles, T. J., Khan, M., Sastourne-Haletou, P., Triola, M., Zhou, H., Kito, Y., Kaisari, S., Fenyo, D., Rona, G (…)2026-05-10
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Inter- and Intra-individual Variability in Oral Food Processing and Its Impact on Aroma Release

Este estudo utiliza monitoramento PTR-MS em tempo real combinado com rastreamento respiratório e comportamental para quantificar como as diferenças inter e intra-individuais no processamento oral e na deglutição influenciam significativamente a cinética da liberação de aromas dos alimentos.

Andriot, I., Grossiord, D., Beno, N., Chabin, T., Laboure, H., Lucchi, G., Martin, C., Mourabit, O., Piornos, J. A., Sai (…)2026-05-08
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Mathematical Modeling of the Canonical Aryl Hydrocarbon Receptor Pathway

Este estudo desenvolve e calibra um modelo mecanístico de equações diferenciais ordinárias da via canônica do receptor de hidrocarboneto arílico utilizando dados de expressão gênica resolvidos no tempo provenientes de diversos ligantes, revelando que as respostas transcricionais específicas de ligante são codificadas principalmente no nível da regulação transcricional e não em eventos de sinalização a montante.

Wieland, V., Blum, T., Iriady, I., Reverte-Salisa, L., Pathirana, D., Foerster, I., Weighardt, H., Hasenauer, J.2026-05-08
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Ensemble kinetic modelling links residual enzyme activity to clinical symptoms in mitochondrial β-oxidation defects

Este estudo aborda o desafio da incerteza dos parâmetros cinéticos na modelagem da oxidação de ácidos graxos mitocondrial (mFAO) ao construir um conjunto de 51 modelos computacionais validados, que vinculam com sucesso a atividade enzimática residual aos sintomas clínicos e revelam mecanismos fisiopatológicos distintos entre as deficiências de mFAO de cadeia longa e de cadeia curta/média.

Odendaal, C., Krebs, O., Bakker, B. M.2026-05-08
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Accessible Gibbs energy at metabolic activation limits long-term cell growth

Este estudo demonstra que a energia de Gibbs acessível durante a ativação metabólica atua como uma restrição termodinâmica que limita o crescimento celular a longo prazo ao aprisionar as células em estados de baixo crescimento, um mecanismo confirmado experimentalmente ao mostrar que o tamanho dos pools de metabólitos conservados dita as taxas de produção de ATP em estado estacionário.

Barreto, Y. B., Jongman, E. P. H., Patino-Ruiz, M. F., Grundel, D. A. J., Uysal, M., Coenradij, J., Poolman, B., Heinema (…)2026-05-05